苜蓿根部腐烂可能是由于以下原因导致的：
1. 过度浇水：如果苜蓿生长在排水不良的土壤中，或者过度浇水，可能导致土壤中的水分过多，根部难以呼吸，进而发生腐烂。
2. 土壤酸碱度不平衡：苜蓿生长需要适宜的土壤酸碱度，如果土壤过酸或过碱，可能会导致根部腐烂。
3. 病害和虫害：苜蓿在生长过程中可能会受到各种病害和虫害的侵害，如根腐病、蚜虫等，这些病害和虫害可能导致根部腐烂。
4. 营养不良：苜蓿需要充足的养分才能正常生长，如果土壤中缺乏适宜的养分，可能会导致根部腐烂。
综上所述，苜蓿根部腐烂的原因可能有多种，需要仔细检查和分析。建议在种植苜蓿时，注意土壤排水和酸碱度的平衡，及时进行病虫害防治，保证土壤充足的养分供给，以确保苜蓿健康生长。
