农业生产者销售自产农产品是免征增值税的,其不能开具增值税专票,只能开具农产品销售发票。
从农户收购农产品，按照收购单位自行开具农产品收购发票上注明的农产品买价和11%的扣除率计算的进项税额，从销项税额中抵扣。目前，农业生产者销售自产农产品是免征增值税的，其不能开具增值税专票，只能开具农产品销售发票。
对于小规模纳税人销售农产品也是不得开具增值税专票的，只能开具增值税普通发票。对于零散经营的农户，应由收购单位向农民开具收购发票。上述三种凭证也能作为进项税额扣除。
这里要注意以下几点：
1、哪些产品属于初级农产品？《增值税暂行条例实施细则》第三十五条规定，初级农产品具体范围由财政部、国家税务总局确定。根据财税52号、财税9号规定，由《农业产品征税范围注释》确定初级农产品的范围。
2、何为农业生产者？这里的农业生产者，既包括企业，也包括农业合作社和个人（个体工商户和自然人）。
3、如何开票？根据规定，销售免税农产品，不能开具增值税专用发票，只能开具增值税普通发票，税率选“免税”。如果购货方是企业的话，还需要填写购货方纳税人识别号，否则对方无法抵扣进项税，成本也可能不得税前扣除。
农民种植合作社开发票怎样交税？
农业合作社给开的普通发票可以抵税。
增值税一般纳税人从农民专业合作社购进的免税农业产品，可按13%的扣除率计算抵扣增值税进项税额。
农业合作社是建国初期为恢复生产，增强农民抵御自然灾害的能力而成立的农村生产互助组织。是人民公社的较低级形式，在当时人力物力有限的情况下产生。
发票是指一切单位和个人在购销商品、提供或接受服务以及从事其他经营活动中，所开具和收取的业务凭证，是会计核算的原始依据，也是审计机关、税务机关执法检查的重要依据。收据才是收付款凭证，发票只能证明业务发生了，不能证明款项是否收付。
发票是指经济活动中，由出售方向购买方签发的文本，内容包括向购买者提供产品或服务的名称、质量、协议价格。除了预付款以外，发票必须具备的要素是根据议定条件由购买方向出售方付款，必须包含日期和数量，是会计账务的重要凭证。
中国会计制度规定有效的购买产品或服务的发票称为税务发票。政府部门收费、征款的凭证各个时期和不同收费征款项目称呼不一样，但多被统称为行政事业收费收款收据。为内部审计及核数，每一张发票都必须有独一无二的流水账号码，防止发票重复或跳号。
发票就是发生的成本、费用或收入的原始凭证。对于公司来讲，发票主要是公司做账的依据，同时也是缴税的费用凭证；而对于员工来讲，发票主要是用来报销的。
《中华人民共和国增值税暂行条例》第一条 在中华人民共和国境内销售货物或者加工、修理修配劳务（以下简称劳务），销售服务、无形资产、不动产以及进口货物的单位和个人，为增值税的纳税人，应当依照本条例缴纳增值税。
农民专业合作社要到主管国税机关办理税务登记、接受税务管理，领取普通发票，对外开具加盖了”农产品销售专用章”发票．从2009年起，农民专业合作社也可以申请认定增值税一般纳税人，开具增值税专用发票。
农民专业合作社税收优惠政策整理:
1、农民专业合作社取得的涉农财政性资金，暂不计入收入总额计算应纳税所得额。
2、农民专业合作社取得的捐赠收入，暂不计入收入总额计算应纳税所得额。
3、农民专业合作社对农村交通等公共设施建设的支出，列入农民专业合作社的固定资产，分期折旧在税前予以扣除。
4、经营采摘、观光农业的农民专业合作社，从事农、林、牧、渔业项目的所得，按《中华人民共和国企业所得税法》第二十七条规定减免企业所得税。
5、农民从农民专业合作社取得的盈余返还，为农民销售自产农产品所得，免征个人所得税。
6、农民专业合作社用于临时性生产用房的城镇土地使用税和房产税，纳税确有困难的，可申请困难性减免。
以上所称农民专业合作社，是指依照《中华人民共和国农民专业合作社法》规定设立和登记的农民专业合作社，上述规定自2008年1月1日起执行。(苏地税函[2009]11号)
7、自2008年1月1日起，农民个人实际出资(入股)的农民合作组织，其建造的“打工楼”出租收入，按照苏政办发[2006]136号文件规定的综合税率5%征收相关税收。(苏地税函[2009]11号)
8、自2008年7月1日起，对农民专业合作社与本社成员签订的农业产品和农业生产资料购销合同，免征印花税。(财税[2008]81号)
