一般情况下，北方的土壤缺磷少氮富钾，苜蓿属于高蛋白牧草，自身根瘤可以固氮，但是植物合成蛋白质，除了氮元素外，磷也是关键元素，所以施肥应以磷肥为主。
在实际操作中，播种前，有条件的最好施用农家肥做为底肥，没有农家肥，可以施用每亩50公斤过磷酸钙+10公斤复合肥做为底肥，之后在每年苜蓿返青后及每次刈割后施用每亩15公斤尿素或10公斤二铵（最好是二铵，苜蓿虽然能够自身固氮，但是为满足高产，其自身吸收的氮远远不够），同时在每年的冬季或者早春，每亩施用50公斤以上过磷酸钙。
笔者通过试验发现，重施磷肥有助于苜蓿高产，有助于根瘤形成发达，有助于防止苜蓿退化等等。但苜蓿不同于普通粮食作物，氮肥施用不宜过多。
