鱼菜共生发展不起来的原因如下：
土地政策限制。不同性质的土地用处不同，常规的土地性质并不适用于鱼菜共生系统，且土地政策一直在变化。
缺乏成熟技术。国内尚未形成成熟的养殖模式，缺乏科学成熟的成套技术，缺少管理、技术等方面的对口人才。
成本高。鱼菜共生模式涉及水产养殖和蔬菜种植两个不同的专业领域，鱼类和蔬菜共用一套水体，如果鱼或菜但凡有一个生病，需要额外花费大价钱在维持环境稳定平衡上。
销售困难。尽管从鱼菜共生出来的产品绿色健康，但短时间内无法得到普通消费者的认可，而要面向高端市场，如何打通销路也是一个问题。
因为鱼菜共生还没有大规模种植和被人熟悉缺少规范性和科学性
