农产品质量安全可追溯制度分为农业生产环节可追溯制度, 包装加工环节可 追溯制度,运输、销售过程可追溯制度三种基本类型。
（一）农业生产环节可追溯制度。农业生产环节可追溯制度主要推行良好的生产规范GMP），即所有生产过程，从种子处理、土壤消毒、栽培方式、灌溉、施肥、使用农药到收获都要有详细记录，能够追溯到哪个生产基地、品种、生产时间，从源头上保证农产品质量。
（二）包装加工环节可追溯制度。在农产品加工生产过程中实行的可追溯形式有良好生产规范（GMP）和危害分析与关键点控制（HACCP）两种管理体系。实行GMP 和HACCP 都是以第三方认证形式建立的产品质量可追溯制度，人们可以不强调农产品认证，但必须要求农产品生产的每一个环节都是可控、安全和可追溯的。因此，GMP 和HACCP 管理体系是企业生产过程中的选择。
（三）运输、销售过程可追溯制度。所有涉及农产品供应商都必须建立农产品可追溯制度。具体实施起来，可以分为前追溯制度、中追溯制度和后追溯制度。
