小尖椒植株成活后，需进行六次追肥，小尖椒在栽培前期表现为苗期疫病，可选用30%根病净可湿性粉剂800～1000倍液浇根，每7天1次，连浇2～3次。或是使用金宝贝微生物菌肥1－2公斤，兑水3—4倍，灌于根部，冬季尖椒约10～15天一次，夏季约一周一次，直到采摘期结束。
小尖椒第二次追肥是在尖椒现蕾时：对磷的需求量增大，否则蛋白质合成受阻，植株生长缓慢，植株短而粗，同时磷不足影响蔗糖运输，植株内糖相对积累，并形成较多的花青素，使植株呈紫红色，还容易引起引起落蕾、落花的现象。所以磷肥是必不可少的，但是硼和钙肥也应该适当施用，不仅起到保花的作用，还会避免尖椒出现软腐现象。
小尖椒第三次追肥是5月下旬：簇果实开始长大。这时需要大量的营养物质来促进枝叶生长，否则不但影响结果而且植株生长也受到抑制。，适当增加氮肥，避免提早结果，对总产量造成影响。
小尖椒第四次追肥在6月下旬：天气转热，正是结果旺期，要做好水肥管理。小尖椒生长前期正逢高温干旱时期，应认真做好降温保湿工作。一般是通过浇水和覆盖遮阳网来调节温、湿度；如遇大阵雨或暴雨，应及时开沟排水，防止水淹。如遇连续阴雨，则应尽量多通风，降低湿度，以减少病害的发生。
小尖椒第五次追肥在8月上旬：气温高，小尖椒生长缓慢，叶色淡绿，果实小而结果少，每亩施用硫基高氮高钾复合肥10-20公斤结合金宝贝微生物菌肥1-2公斤，可促进辣椒秋后枝叶的生长和结果。
小尖椒第六次追肥在9月中旬：小尖椒生长后期根系吸收养分能力下降，为了促进根系生根及防止根系老化可适当增施磷肥。因结果期辣椒植株消耗养分较多，建议每亩施用高氮高钾硫基复合肥或水溶肥肥料15-20公斤，这样可及时补充植株养分，如能配合金宝贝微生物菌肥1-2公斤，可提前上市5-7天，延长采摘期。
在尖椒旁边开小沟，把肥料放进沟内，然后把沟用土把沟填平就可以了。
尖椒施肥可采用墩肥，就是在离尖椒根部三寸挖坑施肥，或者跟水冲肥。
