NFC果汁也是需要加热的。一方面，水果中可能含有致病细菌，如果不杀灭的话，在储存中还会进一步生长，所以商业化的果汁，杀灭是必需的。
一般而言，会加热到85 °C以上，而常温保存几个月的，往往是通过UHT（超高温瞬时灭菌，一般是135 °C以上）。
另一方面，果汁中会有一些酶需要灭活。比如橘子汁中含有比较多果胶甲基酯酶，它可以把果胶分子上的甲氧基脱掉，使得果胶可以与氧离子结合，形成不可溶的沉淀。
再比如苹果汁中有较多多酚氧化酶，会把苹果汁中的多酚氧化，使得苹果汁颜色变深。
这些加热虽然只有几秒到一二十秒，但也足以对风味物质产生明显影响。
