鲜菇包装必须在清洁卫生、无异味、气温不高于3℃的低温房间进行。包装用具及工作人员制服，要保持清洁卫生，定期消毒。非工作人员不得任意出入包装场所，以防库温上升和传带病菌杂物污染产品。
包装必须在确定出口日期前进行。首先剪短鲜菇菇柄，留长约2.5厘米，边剪柄边包装，若过早剪菇柄，菇柄剪口会氧化褐变影响外观。鲜菇用塑料薄膜袋装盛，每袋装入同级香菇5000克，抽真空后再装到泡沫塑料箱中，箱口黏合密封并套上双瓦楞纸箱，纸箱口加黏胶纸带。
小包装通常采用泡沫塑料袋制成小托盘，每盘装入鲜菇100克或200克，整齐排列，有的菌褶朝外，外面包裹上一层保鲜薄膜密封不透气或抽成真空，然后装入纸箱，箱口加黏胶纸带。包装完毕，做好标记，待运。
