肥料的分类方法和种类很多，成分性质差别也很大。一般可分为无机肥料、有机肥料和生物肥料。
无机肥料又叫化学肥料，比如氮肥、磷肥、钾肥、复混肥等等;有机肥料又叫农家肥，如厩肥、绿肥、饼肥、圈肥和堆肥等等;生物肥料又叫细长肥料，属于改善植物营养条件的肥料，不能直接供给养分。根据不同的施用措施还要以分为基肥、追肥、种肥和叶面肥。
还有一种分类是依据作物对元素的需要量划分的，包括大量、中量、微量元素肥料，大量元素肥料如氮肥、磷肥、钾肥;中量元素肥料如钙肥、镁肥和硫肥;微量元素肥料如铁肥、锰肥、硼肥、锌肥、铜肥和钼肥等。
另外，复混肥料中又可以分为两元、三元或者多元复合肥料，复混肥料实际上是二种或者三种主要营养元素如氮、磷、钾的肥料的总称，多元肥料是指不仅含有大量营养元素氮磷钾，同时还含有多种微量元素的肥料。复混肥料的生产都是将多种单元素肥料或者多元素肥料按照不同作物对养分的需要，以一定比例进行混合，并经过一定的生产工艺制成颗粒，然后进行包装而成的肥料，如蔬菜专用有肥、果树专用肥、小麦专用肥等等。
目前还有一种新型的肥料品种称为控释肥料，也可叫做智能肥或者傻瓜肥，如控释氮肥、控释磷肥、控释复合肥等。
