水稻在受淹情况下，通气不良、光合受阻、呼吸消耗加大，生理活动受到极大影剧响，甚至死亡。水稻受淹程度与受淹时的生育期、淹水时间长短、水层深浅等有密切关系。一般苗期耐淹力较强，孕穗期最弱。
水稻被淹后所造成的损失，随着受淹时间长短而不同。水稻苗期耐淹能力相对较强。淹水4天内基本不受影响，淹没6～8天，出水后叶片会干枯死亡，但心叶未死大部分苗可恢复生长。出水后秧苗黑根多、苗矮小，分蘖少，抗病力弱。
分蘖期（移栽后15天）至拔节期水稻受淹，生育进程近乎停止。出水后株高变矮；高位分蘖增多，穗变小；抽穗期拉长，生育期推后延迟2～3天。淹没4天内产量损失较小，4天以上损失显著加大，一般减产2～3成，直至绝收。
水多水深，浸水时间长，造成沤根。及时排水再用咯菌腈，或甲霜铜，或络氨铜锌，或恶霉灵，或枯草芽孢杆菌，或氯溴异氰脲酸，或敌磺钠，或五氯硝基苯等淋灌根部，并叶面喷洒磷酸二氢钾加天然芸苔素加腐植酸活性液肥加恶霉灵。
