在耕地上盖厂房可能涉及违建。
但是是否属于违建需要考虑多方面因素，例如是否取得相关部门的许可，是否符合城市规划等。如果未经许可并且不符合城市规划，那么属于违建。
根据《中华人民共和国土地管理法》相关规定，任何单位和个人进行建设，需要使用土地的，必须依法申请使用国有土地。建设占用土地，涉及农用地转为建设用地的，应当办理农用地转用审批手续。
根据中国的土地管理法规，耕地是指用于农业生产的土地，一般不允许用于建设非农业用途的厂房。因此；
2006年在耕地上盖的厂房可以被视为违建。违建是指未经批准或违反规定在禁止建设区域或未取得相应手续的区域建设的建筑物。因此，这种情况下的厂房可以被认定为违建，可能需要进行相应的处罚和整改。
保护耕地是国策，耕地不允许建房，耕地提供口粮和瓜果蔬菜供应。因此，耕地建房 ，无论时间早晚，都是违建
