云南省农业科学院药用植物研究所是为适应“云药”产业发展而于2004年专门设立的从事药用植物资源保护与可持续利用为主的社会公益型省级科学研究机构。
主要任务是立足于云南药用植物资源的优势，充分利用省内外科技资源，运用现代化的科学技术与方法，研究解决“云药”产业发展中的药用植物资源保护、品种选育、种植生产和采收加工的关键技术问题，并建立集药用植物资源保存、研究、开发应用为一体的科研平台和中药农业的科技服务体系，从而为“云药”产业的可持续发展提供技术支撑，并积极与企业和药农合作，促进科技成果的转化与示范推广，推进云南农业产业结构的调整和区域经济的发展。
师资力量：研究所现有38名职工，专业科技人员31人，其中研究员1人，副高职称9人，中级职称11人，初职9人，云南省技术创新人才1人，云南省农科院中青年学术带头人3人；博士及在读博士4人，硕士10人。田间试验基地和种质资源圃300亩，办公实验楼4000 m2，近200万的现代实验仪器设备，收集保存了云南药用植物种质资源300多种，近3000多个居群或种源，建有4000份云南药用植物资源提取物库，并成立有中-韩生物技术研究中心和药用植物研究所文山分所2个二级机构。
