有机大米认证的标准根据不同的国家，不同的认证机构，其标准不尽相同，在我国，国家环境保护总局有机食品发展中心制定了有机产品的认证标准，2000年12月美国公布了有机食品全国统一的新标准，日本在2001年4月公布了有机食品法(JAS法)，欧洲国家使用欧盟统一标准ESS NO﹒2092/91及其修正方案和1804/99有机农业条例。
有机大米认证的标志在不同国家和不同认证机构是不同的。在我国，国家环境保护总局有机食品发展中心在国家工商局注册了有机食品标志，中国农业科学研究学院茶叶研究所亦制定了有机茶的标志，2001年国际有机农业运动联合会(IFOAM)的成员拥有有机食品标志380多个。
有机大米认证的方法以实地检查认证为主，检测认证为辅，重点是农事操作的真实记录和生产资料购买及应用记录等。A级绿色食品和无公害食品的认证是以检查认证和检测认证并重的原则，同时强调从土地到餐桌的全程控制，在环境技术条件的评价方法上，采用了调查评价与检测认证相结合的方式。
