秋季是食用菌播种的季节，做好各食用菌品种的菌种、菌棒制作，发菌和出菇前的管理工作，可为丰收打下坚实的基础。在食用菌生产过程中应遵循“预防为主，综合治理”的原则，生产采用物理防治、生物防治和农业防治，禁止使用任何农药。土壤和棚室消毒严禁使用违禁农药。
香菇
（一）栽培管理秋季种植选择中低温型品种，一般9月份开始对菌棒进行转色（8月份菌棒制作完成），陆续移入出菇棚，控制湿度进行出菇管理，低海拔地区可推迟到10月中旬。秋菇10月中下旬第一茬出菇结束，第二茬出菇结束约在11月底，每茬出菇结束后通风晾棚1周补水。
（二）病虫害防治秋季栽培由于温度较低，病虫害发生较少，以预防为主，出菇期间注意防治菇蚊、菇蝇、干腐病等病虫害。
黑木耳
（一）发菌管理黑木耳秋季管理包括：发菌、排场、出菇、采收等环节。要注意培养室清洁卫生、干燥、通风良好、避光，室温保持24℃左右，每天通风2次左右。
（二）菌袋划口、催耳用打孔机把菌袋打成“一”字型或“人”字型口，一般打孔180个/袋左右。根据天气情况，如能保证5-7天不下雨，可直接排场催耳，阴雨天气需在室内催耳。
（三）摆袋排场对收割好的水稻田或其他地块，撒石灰消毒处理，有条件铺上稻草。交叉摆放，袋间距125px左右，一般8000袋/亩。
（四）出耳管理耳芽形成并封面后雾状喷水30分钟/次，使耳芽保持湿润，根据气温和空气湿度，适当增减喷水次数，一般一天两次，维持7天-15天左右，至黑木耳逐渐成熟。
（五）适时采收耳片即将展平、边缘变薄、耳根收缩，八成熟时采收，此时耳片品质最好。采摘下来的黑木耳及时烘干贮藏。注意采收前1-2天停止浇水，根据天气情况，选择连续晴天、阳光充足时抓紧抢收。要采大留小，不留根。
（六）采后管理采收后经过10天左右菌丝恢复期（期间最好有避雨设施，不沾水），让菌丝重新积累营养，恢复生长活力，耳芽长出后再开始喷水，继续采收。
（七）病虫害防治加强制种、发菌和出耳管理，控制好温度、湿度和通风。随时排杂，清理场地，防止病虫害发生。
