选择水果黄瓜的春茬或者秋茬育苗，准备育苗棚和将种子处理后，父本比母本提早7天～10天播种，进行苗期管理，定植前1个月整地，定植后进行田间管理，授粉前1天，使母本田不见雄花，将母本在次日清晨即将开放的花冠见黄的雌花蕾夹严，授粉前1天傍晚摘下父本在第二天清晨即将开放的花冠见黄的花蕾，上午将摘下的父本花粉涂抹在母本的雌花柱头上，每2～3朵雄花授1朵雌花花粉，每株母本上授粉4～5朵雌花，选留3个授粉果实，进行病虫害防治，采收后将瓜瓤发酵、冲洗、筛选得到种子。本发明能够提升制种量，减少瘪籽率，降低水果黄瓜杂交制种技术难度，减少水果黄瓜种子成本。
