1950年，山东省海水养殖研究所前身“国营山东水产养殖场”在青岛成立。
1958年，根据山东省人民委员会编委会和山东省水产局的决定，改为“山东省水产养殖试验场”。
1961年，山东省水产厅将其更名为“山东省海水养殖研究所”，。
1971年，山东省海水养殖所合并到原黄海水产研究所，总称为“青岛海洋水产研究所”。
1976年，改为“山东省海洋水产研究所”，育苗试验场为“山东省海洋水产研究所育苗试验场”。
1977年，分设为“山东省海洋水产研究所”和“山东省海水养殖研究所”，至此，山东省海水养殖研究所正式恢复并延续至今。
