水体营养化是因为人类的生产、生活中把过多的物质（污水）排放到了自然水体中，使得自然水体中化学物质的含量大大超过原有含量。钙、镁离子对生物的生长并起不到太大的作用，不能算是富营养化的主要元素，而通常氮和磷是否超标才是衡量是否富营养化的参考因子，因为氮、磷才是植物生长从水中吸取的大量元素。所以严格来说其他元素的超标只能说是水体污染而不是富营养化。
富营养化只是个水体的状态，怎么和环境、生态造成不利影响呢，途径是这样的：富营养化之后水中的植物会快速生长，甚至达到爆发状态（形成水华），这些植物的过度生长并不都是好事，例如蓝绿藻的爆发会分泌有毒物质，使水中其他生物致死，死后细菌又爆发，过度耗氧或又分泌新的毒物，造成恶性循环
