穴盘育苗用大棚由于采用轻基质无土育苗，因此可以不考虑土壤性能条件。穴盘育苗大棚在选址时，单个大棚应考虑在其东、西、南三面无高大的建筑物和树木。大棚的群体布局时应考虑在群体四周有天然的或人造的防风屏障，以利于保持大棚群体内稳定的小气候。
由于育苗盘放置在床架上，为了提高大棚的保温性能，应建造围墙式钢架结构加温大棚。这种大棚与普通生产大棚不同的是：把大棚骨架固定在四周70厘米高的墙体圈梁上，墙体厚度为37厘米，地下基础应以当地的冻土深度为参考数值，北京地区以70厘米为宜，基础墙体厚度为37厘米，棚长50～60米，南北延长，跨度10～12米，每棚面积为500～600米2，棚的中高为3.5～3.7米，脊高（从墙体圈梁上部算起）为70厘米，以保证行走式喷水喷肥车作业时两臂不受任何影响（图11）。
图11 穴盘育苗用大棚（单位：米）
穴盘育苗大棚应选择透光性能好的无滴防老化薄膜，减少频繁换膜造成的劳动力浪费。在大棚内部应选用0.05～0.08毫米厚的薄膜做两层保温幕，以提高棚内温度，减少热量散失。
为了保证在寒冷季节提供育苗所需的温度条件，棚内需要设置加温设备，有条件的地方可以暖气加温。暖气片的疏密程度以当地气候条件和锅炉提供热量灵活掌握。例如：北京花乡育苗场采用圆翼片水暖加温，高温棚（用于青椒、茄子育苗）平均每3.2米2一节圆翼片；中温棚（用于番茄育苗）平均每4.2米2一节圆翼片；低温棚（用于甘蓝类蔬菜育苗）平均每6.4米2一节圆翼片。圆翼片均匀地铺设在苗床下面，在苗床架周围围上塑料薄膜，避免热气向外散发，保证根系处于良好的温度条件，使秧苗得到冷头暖脚的环境。高、中、低温棚温度变化见表11、12。
表11 北京花乡育苗场育苗大棚（高温棚）温度变化（℃）
表12 北京花乡育苗场育苗大棚（中、低温棚）温度变化（℃）
从表11可以看出：凌晨6：00时外界温度最低，在北京地区1月份最寒冷季节高温棚内温度可达到18.2℃，比外界提高28.4℃。表12中2月份测试结果是：中温棚内温度为16.4℃，比外界提高20.4℃；低温棚内温度为8.8℃，比外界提高12.8℃。由此可见，在北京地区气候条件下，采用围墙式钢架大棚加上加温设施，基本上能够保证冬春育苗季节各种不同蔬菜对温度条件的要求。
一是温室施用硫酸铵和碳酸氢铵。硫酸铵是一种生理酸性肥料，施用后会增加土壤酸度，破坏土壤结构。施加碳酸氢铵后，大量氨气挥发。当氨气达到一定浓度时，不利于蔬菜的生长。二、含氯肥料在温室中的应用。氯离子会降低蔬菜的淀粉和糖分含量，降低蔬菜的品质。而且氯离子残留在土壤中，会导致土壤酸化、土壤脱钙、土壤板结。三是干旱条件下的施肥。蔬菜是喜水作物。土壤干燥时施肥，不仅会充分发挥肥效，还会使土壤溶液浓度突然上升，容易导致蔬菜根部烧焦。因此，蔬菜施肥应与灌溉相结合，沟灌施肥，灌溉前埋肥，或做好追肥。
番茄种子相对较小，储存的营养较少。因此，如果发芽速度太慢，会因为时间太长而消耗过多的营养，从而损害幼苗的质量。为了加快番茄幼苗的出苗，需要适当提高这一阶段的温度。这不仅有利于幼苗的早期萌发，而且可以促进幼苗整齐生长，为后期管理奠定良好的基础。番茄苗期应做好四个阶段的温度管理，坐果早、均匀、产量高在这个阶段，昼夜温度应保持在22-30摄氏度之间，温度最高，温度最低。同时要促进苗木快速出苗和整齐生长，配合覆土和保湿管理。首先，水要充足，覆土厚度不宜过厚，最好在0.5cm左右，覆土要均匀。出苗后当1/3的番茄种子从拱土中脱出时，需要揭开塑料薄膜。揭膜时间晚的话，拱土初期的幼苗会因为高温和湿度过大而形成高足苗。
除了早期揭膜外，这一阶段还应严格控制环境温度。如果温度过高，特别是液体温度过高，容易形成高脚病苗，湿度过高高脚病苗的发生更严重。番茄苗期应做好四个阶段的温度管理，坐果早、均匀、产量高防止高脚苗出现的关键因素之一是适当降低温度，这个阶段温度要控制在15-25摄氏度之间，中午温度最高，太阳出来之前温度最低。同时，为了防止过度生长，应该做好控水工作。保持适当的缺水有利于壮苗的形成，无需浇水，温度允许时应加强通风。当番茄幼苗的第一片真叶展开时，苗圃就会变得拥挤。如果继续生长，会因为相互荣耀而加速向上生长，形成高足苗。高足苗会因为第一个花穗的节点位置上移，延迟挂果和成熟上市的时间。
这个阶段的温度范围应该控制在16-24摄氏度之间，温度最高，日照出来之前温度最低。同时，为了促进幼苗的生长，应在幼苗分裂后倒入足够的水，以提高供水能力，促进根系吸收。分苗的水温应接近环境温度。花芽分化阶段番茄第二片真叶展开时，进入花芽分化阶段。在此阶段，应特别注意温度管理。温度过高或过低都会导致花芽分化不良，容易导致后期畸形果增多，挂果数量减少，不利于形成高产优质栽培。在这个温度管理阶段，昼夜温差要适当加大，这样可以促进叶片光合作用产生的有机物质的积累，为花芽分化提供充足的能量和养分，为良好的花芽分化打下良好的基础。相反，由于缺乏有机营养和能量供应，花芽会减少，畸形果增多，果实整齐度变差。
