随着技术的发展，现在潜艇的水下排便系统已经解决了便器直通舷外的问题，基本是由带有联动装置的便器、止回阀、储存器、排污阀和水箱以及管道组成，处于常闭状态的止回阀只有在冲水时才会通过脚踏装置打开，冲水结束后又自动关闭，储存器是一个150L到190L的焊接压力容器，进口与便器相连，出口与排污阀相连，粪便被冲进储存器之后，会被暂时存储，待条件允许，再使用压缩空气排出潜艇，避免了操作失误而导致海水倒灌的问题，而且在使用中也不再那么繁琐。
现代潜艇食物残渣的处理，是通过压力装置进行压缩打包，罐头盒、矿泉水瓶等也都要压扁，待上岸之后将垃圾包进行统一丢弃，在不能上岸时，会通过潜艇的炮射装置将垃圾包抛出去，食物残渣如果直接排出，会引得海鸥等鸟类来吃，潜艇被反潜机发现的概率就大大增加。
