首先，就是农业种植以及生产的问题。日本的国土面积十分狭小，同时还有群山覆盖，所以可用于耕种的平坦土地就很少。作为日本的农户，很难保证能够有足够的产量，所以价格就比较高。同时对于蔬菜来说，日本对于食品的要求非常的严格，本来蔬菜的保质时间就非常短，所以能够达到质量标准的，并且能及时送到商户的蔬菜就十分有限，所以成本高就会直接反映到价格上。
另外的一个很重要的原因就是，日本的政府对于农协的干预。之前已经提到日本的果蔬产量非常小，但是不要忘记日本的人口可一点都不少，但是又没有耕地，那么就只剩下一个办法——进口。试想如果日本大量进口国外品质过硬，更主要的是成本更低的果蔬，日本的农民会怎么想？日本的农协握有大量的选票，政府为了不侵犯农民的利益，只允许大量进口本地不种的果蔬，对于会对本地果蔬造成威胁的进口食品，会严格把关，绝不能侵犯农民的利益。
所以果蔬的价格不会因为进口降低。但是，日本的水果相比于蔬菜保质时间要长很多，而价格却一样昂贵，这又是为什么呢？实际上日本的水果的种植要求更加苛刻，举例来说，日本的一些精装的水果不仅仅外观上不能有任何伤痕，个头的大小都要一致，包装上还会说明水果在产地，甜度，是否含有转基因成分等各种详细的信息。
很多时候的这种水果，并不是买来吃的，而是专门为了应酬送人的。日本人也没有奢侈到买这种水果来吃的地步，只能说水果的用途不同。
