降温除底热
在高温的时节，由于连续高温，多在上半夜导致池塘底水发热，这也是晚上及凌晨易缺氧的诱因之一，当池塘底层水发热的时候，这时候使用硫代硫酸钠便可解决，一般在傍晚直接干撒，但因为硫代硫酸钠使用之后会引起溶氧降低，尽量与增氧剂配合使用。
2.去除水中余氯
在清塘之后用，有些地方清塘会使用漂白粉等氯制剂，使用氯制剂三四天后使用硫代硫酸钠，可与具有强氧化性的次氯酸钙发生反应，生成无害的氯离子。
3.解除有机磷类杀虫剂的毒素
有机磷类杀虫剂水产上常用的是辛硫磷和敌百虫等，主要是杀虫使用，使用之后可以使用硫代硫酸钠解除余毒。
4.解除重金属离子的毒素
重金属在水产养殖使用的不多，多是利用铝、铁离子类物质用来作絮凝剂使用，从而净化水质。
另一种是用来杀虫用的硫酸铜、硫酸亚铁。硫代硫酸钠的硫离子可以和重金属离子反应生成无毒的沉淀，解除重金属离子的毒性。
5.降低池塘氨氮
硫代硫酸钠降氨氮的具体原理目前还不太清楚，但是在实际应用中硫代硫酸钠快速降低氨氮的效果还是比较不错的。
6.治理倒藻引起的黑水、红水
倒藻后水发黑、发红，主要原因是倒藻后死亡的藻类被分解成各种大分子、小分子的有机质，使得水质看起来发黑或者发红，硫代硫酸钠具有络合作用，可以络合这些大分子、小分子的有机质，从而达到治理黑水、红水的效果。
7.释放硫原子，有一定的消毒作用
硫代硫酸钠基本不会被用来当做消毒剂使用，主要是硫原子不稳定，消毒作用持续时间短、消毒作用比较弱。
