如果发现番茄上有虫子，可以采取以下方法进行处理：
1. 洗涤法：将番茄放在流动水下冲洗，或者用淡盐水浸泡一段时间，再彻底冲洗干净。这样可以将表面的虫卵、虫粪和细菌洗去。
2. 切割法：找到虫子的位置，切掉被侵蚀的部分，保留健康的部分食用。切割后的部分不要再食用，最好处理掉。
3. 煮沸法：把番茄放入沸水中煮2-3分钟，这样可以将虫子杀死并将它们的体内外生物杀灭。
4. 冰冻法：将番茄放入冰箱中冷冻几小时，这样同样可以杀死虫子和细菌，但是可能会影响番茄的口感。
无论采取哪种方法，处理完后要仔细检查其它番茄是否也受到了侵蚀。建议购买时选择外观完整、色泽均匀、没有明显损伤的番茄，存储时保持干燥清洁，最好不要暴露于阳光下。
