1、资源化利用。大规模、集约化养殖业产生的粪便量大，往往难以还田，必须借助设备才能把畜禽粪便转化成可利用的资源。
2、减量化处理。在畜禽饲养生产中，通过多种途径，实施“雨污分离、干湿分离、粪尿分离”等手段消减污染物的排放总量，减少处理和利用难度，降低处理成本，为提高资源化水平创造条件。
3、无害化处理。禽畜粪便中含有大量的有害微生物，畜禽粪便在资源化利用或合法排放时，必须进行无害化处理，防止污染环境。
4、生态化处理。将畜牧业回归农村，促进种植业和畜牧业紧密结合，以农养牧、以牧促农，实现生态系统的良性循环，是解决畜禽养殖污染的主要途径之一，加强农牧结合，又可为绿色食品及有机食品的生产提供基础保证。
5、低廉化治理。在资源化和减量化的前提下使用高效、实用、廉价的治理技术，才能真正实现畜禽养殖业的经济发展与环境保护的双赢。
6、产业化和规模化发展。为专业化处理与利用畜禽养殖粪污提供条件，并提供优质肥料，是畜禽养殖污染防治的发展方向。
