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1、 病害增多：重茬会造成土传病害频繁泛滥，如软腐病、根腐病、病毒病等。连年耕作使土壤中的病原菌不断积累，益生菌被严重抑制，这些病原菌很容易侵入植物体，导致多种病害不断发生，危害植物健康。
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2、营养不足：同种植物对营养的要求是固定的，连续栽种会使土壤中的营养元素匮乏，作物营养失衡，难以正常生长。
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3、毒害增加：重茬造成的自毒危害不容忽视，植物在生长过程中会产生一些有毒物质，这些物质会对植株的生长起到明显的抑制作用，将直接影响作物生长。
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4、引发土壤问题：重茬问题引发的化肥使用量增多、益生菌减少等会导致土壤结构破坏，酸碱度变化，盐类积累，易引起土壤盐碱化等问题的发生，影响作物产量。
