根据我所查询到的信息，在商丘市的农业教育机构中，商丘市农业职业技术学校可能是可以考取农药经营许可证的。该学校的办学层次为高等教育，设有农业技术、农业经济等专业，其中农业技术专业包括农药应用技术。该学校也开设了相关的农业技术培训班，例如农业技术人员初级培训、中级培训等。因此，有可能可以在商丘市农业职业技术学校考取农药经营许可证。
需要注意的是，农药经营许可证在中国是专业资格证书之一，由相关部门颁发，需要通过考试或培训获取。不同地区的规定和流程可能有差异，建议您咨询当地农业管理部门或考试机构，以获得最权威和最准确的信息。
