1、价格比较
根据有机食品市场的调查，有机食品比普通食品的价格一般高出30%—80%，有些品种，例如有机蔬菜的价格为普通蔬菜的2—3倍。
2、无污染
食品是否有污染是一个相对的概念。世界上不存在绝对不含有任何污染物质的食品。由于有机食品的生产过程不使用化学合成物质，因此，有机食品中污染物质的含量一般要比普通食品低，但是过分强调其无污染的特性，会导致人们只重视对终端产品污染状况的分析与检测，而忽视有机食品生产全过程质量控制的宗旨。
3、常规农业
在许多情况下，在开始转换之初可能会出现减产，特别是原来严重依赖化肥与农药的地区。但是，在那些原来对农药、化肥使用较少的地区，有机种植就可能不会减产，相反，还可能增产。原因是：
1、通过轮作、间作和各样种植，农业生产系统的多样性得到改善；
2、通过利用作物秸秆还田(或制作堆肥以后还田)，促进了农田养分循环；
3、较好地利用了周围生态系统的有机物质；
4、将养殖业和种植业结合起来，改善了养分的管理水平。
有机食品不许使用化学农药 据中国农业大学食品学院营养与食品安全系副教授范志红介绍，有机食品是不许可使用化学合成农药的。
有机农产品在生产过程中，对各方面都有严格规定，首先，有机食品的种植或养殖过程中，是绝不能使用化肥、激素及转基因等物质的。种植有机农产品的土地、其灌溉用水、环境空气质量均需要符合相关规定。
有机食品严限添加剂种类和用量 有机农作物的肥料一般采用有机农业体系内动物的粪便或作物废弃物，以及未受化学成分污染的废弃物进行堆肥来增添土壤肥力，也会添加物理法获得的矿物质，如磷、钾、镁等元素。
有机农业一般采取非化学方法防虫，比如薄荷、天然除虫菊（提取液）等天然驱虫剂，或石灰、硫磺等天然防虫物质，以及如苏云金杆菌等细菌、真菌防虫制剂。
4、食品区别
我国有关部门在推行的其他标志食品还有无公害食品和绿色食品。无公害食品是按照无公害食品生产技术标准和要求生产的符合通用卫生标准并经有关部门认定的安全食品。严格来讲，无公害食品应当是普通食品都应当达到的一种基本要求。
