玉米种植之前，可使用甲霜灵、 戊唑醇等药物对玉米种子进行拌种，对玉米种子进行充分消毒。使用无菌种子可以大大减少根腐病与茎基腐病的发生，有效预防玉米烂根烂杆问题。
2、控制玉米生长环境，杜绝高湿高热。
春季气候温暖湿润，为玉米烂根烂杆多发期。应注意玉米地排水问题，雨水多或者过量灌溉均会导致根茎部腐烂枝株枯萎。种植时应合理控制种植密度，给玉米植株充足生长空间，创造良好的生长环境，一般植株距离为30-35厘米为宜。
3、合理施肥，供给玉米充足的营养需求。
发生在苗期的烂根烂杆问题往往与施肥不当有很大关系，玉米苗期发育需要吸收大量营养物质，尤其是钾肥。缺乏钾肥的玉米根系、茎部发育不良，对各种细菌真菌的抵抗力差，容易感染根腐病、茎基腐病，导致玉米烂根烂杆。
