一般来说，蔬菜的中上部叶片见光多，光合能力最强，需要的二氧化碳也多，在施用时要均匀地施用在蔬菜的中上部。但要注意不能离作物的生长点太近，以免浓度过高抑制其生长。
适宜的二氧化碳浓度可促进光合作用，但过高(空气中二氧化碳的体积分数超过0.5%-0.6%)则会降低光合作用效率。且二氧化碳比空气重，大量使用以后容易积聚在地面附近，时间长了会使地表土层中含氧量降低，导致根系呼吸作用减弱，从而影响根系的生长发育。
二氧化碳气肥不能离作物太近，这是因为二氧化碳气肥是利用碳酸氢铵分解产生二氧化碳和氨气的原理，释放的二氧化碳可以促进植物光合作用，以达到增产和改善作物品质作用，但是释放的氨气对作物叶子有危害，二氧化碳发生器不会吸收干净氨气，所以气肥不能离作物太近。
