1 生长地区不同。蓝靛果和蓝莓虽属同科，但蓝靛果的生长环境却要求严格，只生长在中国黑龙江大兴安岭东部、俄罗斯远东地区、日本、加拿大等高寒地区，而蓝莓有适合生长在各种环境下的品种，所以蓝靛果较为少见。
2 从营养成分来看蓝靛果的原花青素含量约为蓝莓的15倍，除此之外，蓝靛果含有的维生素、氨基酸、黄酮、维生素b、vc、vpp、钙、铁、磷等微量元素要远远高于其他同类水果。
3 从口味上蓝莓味道酸甜，果肉呈白色。蓝靛果口味酸甜带有一丝苦涩，果肉呈蓝紫色。蓝靛果的甜度小于蓝莓，果香味更浓，果汁含量更高。
4 运输起来蓝莓皮厚硬实，蓝靛果皮包汁多，所以相对不易运输。
