科学施肥主要有三条原则：
一是有机与无机相结合。
土壤有机质是土壤肥沃程度的重要指标。增施有机肥料可以增加土壤有机质含量，改善土壤物理、化学和生物性状，提高土壤保水保肥能力，增强土壤微生物的活性，促进化肥利用率的提高。二是大量、中量、微量元素配合。各种营养元素的配合是配方施肥的重要内容，随着产量的不断提高，在耕地高度集约利用情况下，必须强调氮、磷、钾肥的相互配合，并补充必要的中、微量元素，才能获得高产稳产。三是用地与养地相结合，投入与产出相平衡。要使作物—土壤—肥料形成物质和能量的良性循环，必须坚持用养结合，投入产出相平衡，避免土壤肥力下降。
