深秋之后也需要施肥，提高植株的御寒能力。建议使用有机肥。给它施加肥料时要注意，不能用浓肥，这次施肥更加重要，施肥应该在秋后。为了来年更好的开花，并且提高牡丹花的御寒能力，这次应该以腐熟的粪肥为主，如发酵好的牛羊粪等等，本人使用的是沤制发酵好的鱼肠肥做为底肥。注意恰当混合一些磷钾肥或者复合肥。
休眠的时候要停止施肥。
牡丹花在秋季在施肥时应该在秋季末，应该以腐熟的有机肥为主，恰当混合化学肥料，这样可以改善土壤，改善牡丹花的开花品质，不过我们需要注意的是，牡丹花的根系是肥硕的肉质根，施肥时浓度不可过大，一次施肥不可过多，否则极易腐蚀肥硕的肉质根的。
再者速效的液体肥料一般也不建议使用，特别是粪水更不可使用。
