常用的嫁接西红柿的砧木有 ：
1、科砧2号：科砧2号是以罗马尼亚引进杂交种多代自交选育的DK-6-11-6-6自交系为母本，以T9-6-19-2自交系为父本配制的夏秋茬高抗南方根结线虫的番茄砧木一代杂交种(F1)。无限生长,长势强,根系发达,高抗南方根结线虫。
2、托鲁巴姆：属野生茄子类砧木品种，根系发达，对根结线虫、青枯病免疫。叶色浓绿，长势极强，与番茄各栽培品种嫁接亲和性极好，嫁接后番茄综合抗性强，可作为各茬口番茄栽培嫁接砧木。
3、曼陀罗：属野生茄科类植物，根系发达，对根结线虫免疫。叶色浓绿，长势极强，与番茄各栽培品种嫁接亲和性极好，嫁接后番茄综合抗性强，可作为各茬口番茄栽培嫁接砧木。
