灌溉所用的是地表水（例如河水等）而不是地下水（如井灌）。以地表水源源不断地补给地下水，地下水位自然就上升了。
地下水位长期过高，地下潜水持续蒸发，土壤中的水分不断地以水汽的形式散逸到空气中，而水中的盐份却被带到地面表层并在这里不断的积聚，正是这种“水走盐留”长期的结果最终导致了土壤的盐碱化。
关于地下水位上升的原因：
一、自然原因：降雨量突然增大、喀斯特地区地下河流流向出现了变化以及地震活动异常，这些都可能导致地下水位的上升。
二、人工原因干扰地下水位又分为不合理的和合理的：
1、不合理的像大肆的农业漫灌，灌溉时用水过多，但是排水却不及时，这样也会导致地下水位的升高，甚至还会造成次生盐渍化的灾害。
2、合理的像济南趵突泉、甘肃敦煌月牙泉等天然泉水需要用定期补水来抬高地下水位，用以住旅游景观。
