一般来说，肥料和农药的混合使用，最多是叶面肥和农药之间的混配使用。使用时注意以下禁忌：
碱性农药（波尔多液、松脂合剂、石硫合剂）不能与铵态氮肥、过磷酸钙等混合使用，否则会造成氨挥发损失，降低肥效；
含砷农药不可与钾盐、钠盐肥料混合使用，否则会产生可溶性砷，造成农作物药害；
氨水、草木灰、石灰等碱性化肥不能与速灭威、托布津、井岗霉素、叶蝉散、多菌灵、杀虫菊酯类杀虫剂等农药混用，因为有机磷农药一般在碱性条件下会发生分解；
化肥不能和微生物农药混合使用。化肥大多是挥发性和腐蚀性的。当它们与杀螟杆菌、青虫菌等微生物农药混合使用时，容易杀死微生物，降低防治效果。
另外，叶面肥和农药混合使用时，要注意混合顺序，通常为：叶面肥、可湿性粉剂、悬浮剂、水剂、乳油依次加入，充分搅拌混合后再加入下一种。
1、用途不同
化肥：施肥不仅能提高土壤肥力，而且也是提高作物单位面积产量的重要措施。化肥是农业生产最基础而且是最重要的物质投入。
农药：农业上用于防治病虫害及调节植物生长的化学药剂。
2、分类不同
化肥：学肥料分为速效肥、缓效肥、长效肥。土壤用肥、叶面用肥等。
农药：按用途主要可分为杀虫剂、杀螨剂、杀鼠剂、杀线虫剂、杀软体动物剂、杀菌剂、除草剂、植物生长调节剂等。
3、危害不同
化肥：化肥都是由各种不同的盐类组成，所以长期和大量施用这些由盐类组成的肥料，当肥料进入土壤后，就会增加土壤溶液的浓度而产生不同大小的渗透压，作物根细胞不但不能从土壤溶液中吸水，反而将细胞质中的水分倒流入土壤溶液，就导致作物受害。
农药：农药流失到环境中，将造成严重的环境污染，有时甚至造成极其危险的后果。
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