苹果自花结实率很低，建园树时必须两个以上品种相互搭配，以利授粉。日本关于品种间授粉亲和性的研究比较详细，一些常见品种的授粉组合见表。搭配授粉组合时，还应注意普通型配普通型，短枝型、矮砧树配短枝、矮砧。如果主栽品种为三倍体（如乔纳金、陆奥、北斗），因其花粉败育率高，必须配置两个或两个以上品种，既能为主栽的三倍体品种授粉，又能相互授粉。
见表 苹果主要品种的适宜授粉组合
主栽品种与授粉品种的比例一般是2~3：1，若授粉品种与主栽品种有相同的经济价值，可按1：1等量栽植，这样对授粉最有利。为方便管理，一般主栽品种和授粉品种按比例成行配置。如果授粉品种本身经济价值不高，而以授粉为主时，可按中心式配置，即一株授粉品种周围栽8株主要品种。授粉树和主栽品种间不应超过30m。
