（1）适宜作直播栽培的水稻品种（组合）不足：目前直播用的水稻品种（组合）大都是在移栽情况下选育出来的，不一定都能适合直播稻对品种（组合）的要求，如果把直播作为育种目标之一进行专门选育，可能会培育出更好的直播稻专用品种或杂交组合，会进一步提高水稻的单产。
（2）种植密度难以控制：由于稻田不易整细整平，不能像专用秧田那样精耕细整，田面不平，凹的地方积水缺氧、高的地方缺水干烤，都会影响出苗。特别是连作早、晚稻地区容易受低温或高温影响，稍有不慎，就会造成烂芽、烂秧或伤苗、死苗。因而不能确保一播全苗、齐苗和壮苗，影响高产的最佳种植密度。
（3）草害防除有难度：由于稻田杂草种类多，对除草剂的反应各有差异，施用除草剂要求的条件较高。其使用时期和用量对除草效果影响较大，而且除草剂的效果好坏还与稻田环境密切相关。另外，还牵涉到除草剂使用安全等问题。稍有疏忽，就会形成草荒而影响产量。
（4）容易发生倒伏：因为直播稻播种入土较浅，根系入土不深，主要分布在0～5厘米的表土层，分蘖节入土浅，致使后期容易发生倒伏，尤其是在台风季节更为严重。直播稻倒伏主要是根倒伏。如何改变播种方式和施肥灌水方法，促进根系下扎，有效地防止根倒伏是直播稻高产、稳产所需要解决的重要问题之一。
水稻水直播与旱直播有哪些优缺点？
直播稻由于栽种后就在那地里生根发芽，一直到成长为成株后出穗牢固，期内不会有任何的像栽种稻一样开展拔根栽种的行为。因为不会栽种，因此直播稻就没有根茎的伤害。那也是栽种稻在移植后要经过3-5天时间才可以返青的原因。因此，直播稻的生长期更短一些，根茎都没有负伤，更有利于生长发育。在清水塘乡村，直播稻之前仅用在早稻上，一季稻、晚稻一般都是栽种的。
但是，如今一季稻的种植许多都是直播间进行的。根据栽种的晚稻跟直播的一季稻较为，发觉晚稻的叶子更久，可是生产量则是通过直播的一季稻比栽种的晚稻略微高一些。那也是清水塘乡村好多人更喜欢种一季稻的原因所在。从清水塘本地看来，直播稻的产量栽种稻的生产量略高。水稻直播便是省去稻谷的栽种栽秧这一步骤的水稻种植方法。
那样看来水稻直播更加的节省成本，特别适合现在农村劳动力不足的情况。现阶段水稻直播可以采取人力直播和以及直播间两种方式。稻谷有“秧好大半年稻，壮秧产量高”一说。而栽种稻谷由于抛秧期内有利于规范化管理上肥等，一般易产生壮秧，一般只需保证栽插品质，确保亩基本苗数，有利于迅速返青抽穗产生大穗等。
而直播间水田野草一般多和稻谷同步生长发育，加上总面积大不方便管理等，容易造成“草欺苗”状况，与此同时直播水稻幼苗期肥害状况显著较栽种稻谷多，加上直播间田稻蓟马等病虫害易发生，一般危害幼苗产生旺苗。直播水稻的优点是节省成本，直播水稻免除了传统的预苗、栽种和节约稻田的成本，而随着机械自动化作业的推行，农户能够彻底的解放出来，唯一较为费力的便是锄草和灭虫。
机械水直播在播种前必须放水平整田块，而机械旱直播只需前茬是少（免）耕或板茬麦、油菜茬口上种植，旱直播比水直播更节水、节本。机械水直播由于建立水层，加之草相单一，比机械旱直播化学除草效果好。机械水直播不受外界气候条件制约，而机械旱直播如遇到连续阴雨，机器无法下田，影响正常播种。
