这主要是稻谷、鱼、鸭在空间上不相互影响，鱼生活在水面以下，可以吃水底的一些植物或者浮游生物，而鸭子则吃稻谷上的虫子或者长出水面的青草。稻谷在提供给鱼和鸭子荫蔽的栖息空间的同时，鱼和鸭所排泄的粪便也能为稻谷提供养料，在稻田里不断游动和搅动的时候，也为稻谷松了土。这就形成了了一个封闭的生态循环系统
（1）生态系统的主要成分是生产者，因而在该生态系统中确定为水稻、杂草、蔬菜．鸭子吃水稻、杂草，则鸭子处于第二营养级，若鸭子吃害虫，则鸭子处于第三营养级．
（2）鼠的活动能力强、活动范围比较大，因此调查鼠的种群密度常用标志重捕法．调查该生态系统中稗草的种群密度常采用样方法．
（3）稻田中随着农产品的不断输出导致该生态系统的氮素输出大于输入．
（4）该生态系统运用的生态工程原理：物质循环再生原理、整体性原理、协调与平衡原理、物种多样性原理．
故答案为：
（1）水稻、杂草、蔬菜（生产者）?二、三
（2）标志重捕法?样方法
（3）氮元素不断通过农产品输出该生态系统
（4）物质循环性?整体性协调与平衡物种的多样性
