大部分陆生植物气孔的主要作用之一是光合作用二氧化碳和氧气的进出通道。然而在阳光较为强烈的时候，遭到阳光直射的植物的正面气孔会趋于关闭，此时背面气孔较多的个体更容易维持光合作用。
小麦，水稻，玉米等植物是直立生长的，叶片正反面照射到阳光的概率基本相同，因此没有这方面的自然选择。
水面空气中氧气，二氧化碳含量和水中完全就没在一个数量级，而水面之下氧气的含量随着水深迅速下降。所以水生植物，除开挺水植物（叶片远高于水面）之外，均是气孔开在正面更利于气体进出。
大豆是一种陆生植物，当水淹后，根系完全浸没在水中，得不到充足的氧气，从而会导致根系无氧呼吸，产生酒精，对植物的根系造成毒害，严重下会出现烂根的情况。所以叶片会发黄，生长不良，严重的就死亡。而水稻这种植物则不同，禾本科的一些植物的根系可以直接生长在水中，因为其根系中乙醛酸体发达，可以带些分解掉因为无氧呼吸而产生的酒精，从而解除了对根系的毒害。
