水稻没有性染色体，它的花是两性花，也就是在一朵花中有雌蕊和雄蕊，雄蕊产生花粉，雌蕊中有卵细胞，一般是通过自花授粉的方式产生受精卵，但水稻也能接受其他植株的花粉进行异花授粉产生种子。
水稻是雌雄同花的自花授粉作物。杂交稻是利用杂交一代（F1）来进行水稻生产的，由于它的遗传基础是杂合体，杂种个体间遗传型相同，故从外观上看，群体整体一致。可以作为生产用种，但从第二代（F2）起就会产生很大的性状分离，优势减退，产量明显下降，不能继续作种子使用。因此，杂交稻必须进行生产性制种。常规稻是通过若干代自交达到基因纯合的品种，个体遗传型相同，从外观上看，群体整齐一致，上下代的长相也一样，产量也不会下降。因此，常规稻不需年年换种，但也要注意提纯复壮。
