水稻分蘖期稻根发黄，很难判断是什么病害，需要通过地上部分的病害症状才能加以诊断。水稻根系颜色可判断长势，“白根有劲，黄根保命，黑根有病，灰根要命”，根系发黄，根系吸收能力大大减弱，地上部分生长缓慢，水稻在此期稻根发黄，分蘖能力少甚至不分蘖。
下面介绍几种可能会引起稻根发黄的病害及其防治方法，以供参考：
1、水稻赤枯病
水稻赤枯病是一种生理性病害，俗称“铁锈病”、“红僵苗”，在水稻分蘖容易出现僵苗不发，植株矮小，生长缓慢，下部叶片沿中脉出现赤褐色斑点或条斑；病株根系为黄褐色，根短而少。
防治方法：采取浅水间歇湿润的水分管理，晴热时浅水、阴天可无水，增加土壤的透气性，促进新根生成；及时追施硫酸钾+硫酸锌，或叶面喷施硫酸钾、硫酸锌溶液。
2、沤根，中毒发黄
保深水时间过长，根际土壤缺氧，稻根因缺氧而进行无氧呼吸，产生酒精会毒害根系；田土沤根，产生有毒酸类物质，使稻根受到受损，发黄甚至发黑，稻叶可能出现发红、发黄、
防治方法：需及早排水晒田，让氧气进入土壤，同时氧化土壤中的有毒酸类物质。为促进稻苗恢复，可以考虑喷施等质量可靠的磷钾肥补充磷钾，加喷补充中微量元素，并利用其中所含的活性物质促进生根和恢复。
3、肥害、药害
重度肥害、药害的水稻根系会发黑，轻微药害的水稻根系会变黄，新根（白根）少，植株生长缓慢，稻叶出现相应的药害症状，根据施药情况加以判断药害原因！
防治方法：建议及早喷施碧护、复硝酚钠等药剂缓解药害，在喷施的同时加用叶面肥，促进快速恢复生长。
除上述三种原因外，恶苗病也会引起根系生长不良，后期出现根系发黑，植株分蘖少；水稻缺锌、缺镁等，稻瘟病严重等原因均会导致植株生长缓慢，其根系或多或少会受到影响，出现水稻白根少，根系发黄的情况。
