化学危害主要是农药等有害物的污染和残留，人为的原因多，也特普遍。比如农药残留、滥用添加剂、排放废水、废气、废渣。所以随着现代技术的发展、化学污染就更显出，也更显得严峻，比如农药注册的生产品种有2万多、但我国有的检测种类标准也就几十个，检测的也就3、5个，三废排放更显出，一是有的厂家为了利益和地方政府为了税收，污染不下大力气难禁止，检测也是按通用的食品标准检测，没有的放矢，难起效果。所以说化学污染特普遍。
但也不可孤立的说，但生物危害也不可小瞧，比如现在公认的致癌物黄曲霉毒素的毒性特厉害，也是通过生物化学的原理来危害，但生物污染可以通过控制存放的温度、湿度等条件来尽量遏制。
