属于减免征税的企业，应当将免征的税款按照正常的计提办法予以计算，最后把计提的应缴税款在月底转作补贴收入。所以增值税农产品免税时的会计分录如下：
1、先正常确认收入，
借：应收账款等，
贷：主营业务收入，
应交税费—应交增值税。
2、确认减免税时，
借：应交税费—应交增值税，
贷：营业外收入—税费减免。
小规模纳税人销售免税的农产品怎样做会计分录
财税2016第36号文件附件一：“第二十五条下列进项税额准予从销项税额中抵扣：
（三）购进农产品，除取得增值税专用发票或者海关进口增值税专用缴款书外，按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和13%11%的扣除率计算的进项税额。计算公式为：进项税额=买价×扣除率
买价，是指纳税人购进农产品在农产品收购发票或者销售发票上注明的价款和按照规定缴纳的烟叶税。”
（注：现行农产品增值税税率10%和9%）
一般纳税人农产品收购企业购进农产品（例如购进1000元）：
借：库存商品900，
借：应交税费—应交增值税—（进项税）100，
贷：银行存款1000。
小规模纳税人销售免税的农产品，会计分录如下：
借：银行存款
贷：主营业务收入
贷：应交税费--应交增值税（销项税额）
做完这笔分录后再做一笔分录为：
借：应交税费--应交增值税（销项税额）
贷：营业外收入
“主营业务收入”账户用于核算企业在销售商品、提供劳务等日常活动中所产生的收入。在“主营业务收入”账户下，应按照主营业务的种类设置明细账，进行明细核算。本账户期末应无余额。
扩展资料：
应交税费核算规定如下:
①、本科目核算企业按照税法规定计算应交纳的各种税费，包括增值税、消费税、营业税、所得税、资源税、土地增值税、城市维护建设税、房产税、土地使用税、个人所得税、车船税、教育费附加、矿产资源补偿费等。
②、按规定计算确定的应交矿产资源补偿费、房产税、车船税、土地使用税、印花税等借记管理费用，贷记“应交税费”科目。
借：管理费用
贷：应交税费-
根据财会[2016]22号文件规定，全面试行营业税改征增值税后，“营业税金及附加”科目名称调整为“税金及附加”科目，该科目核算企业经营活动发生的消费税、城市维护建设税、资源税、教育费附加及房产税、土地使用税、车船使用税、印花税等相关税费；
调整后，发生的房产税、车船税、土地使用税、印花税等相关税费，借记税金及附加科目。
借：税金及附加
贷：应交税费-
③、本科目应当按照应交税费的税种进行明细核算。
应交增值税还应分别“进项税额”、“销项税额”、“出口退税”、“进项税额转出”、“已交税金”等设置专栏进行明细核算。
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