巴厘岛咖啡树多生长於中北部海拔1000-2000公尺的高山上，
由于这里阴凉多雾，正适合咖啡树生长， 巴厘岛咖啡的口感不酸不涩，较为甘苦，每年约可成熟一到两回，大约在9月底及3月份两季，每到咖啡果实成熟季节，当地会以人工采收，再进行晒乾、筛选及烘焙等过程。摘下来的咖啡果实先需放阳光下曝晒2个礼拜左右，接着进行人工筛选工作，工人会把咖啡色、青色、有蛀虫及有臭味的咖啡豆筛掉，以免咖啡带有酸臭味，接着则进行烘焙工作，通常以350度高温烘焙一个半小时，然后放置在室内散热，而后便可将咖啡豆包装或磨成咖啡粉出售。
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生豆加工：
1、采摘
分为机械采摘和手工采摘。机械采摘适用于土地平整且大面积种植的咖啡园，全世界最多使用机械采摘咖啡的是巴西，该方法特点是成本低效率高，但采摘的咖啡豆参差不齐，品质较差。对于品质要求较高的咖啡豆一般还是采用手工采摘的方法，这种方法保证了采摘后的咖啡果实大小均匀、成熟度接近、不含其它杂质，也有利于咖啡豆的后期加工。
2、从果实到咖啡豆：
从咖啡果实到咖啡豆的加工方法大致可归类为干法加工和湿法加工。
（1）干法加工：就是将咖啡果实利用阳光和通风等自然条件以干燥脱水，再把干燥的咖啡果实放入脱壳去果肉、果皮和银皮。这种方法是最经济传统的加工方法，采用这种方法处理的咖啡豆能长久地保持香味，但同时也会带有一定的环境气味。目前非洲及亚洲国家许多地区多采用此种方法，不过随着科技的进步，很多地方已经开始使用烘干机烘干咖啡果实。
（2）湿法加工：又叫水洗法加工，采用浸泡方式筛选咖啡果实，再将筛选后的果实通过发酵、挤压等方法去除果皮、果肉和银皮表面粘滑的果浆，加工后的咖啡豆会保留表面的银皮进行存储，这种状态下的咖啡豆称为“羊皮纸咖啡豆”（Parchment Coffee），一直要等到出口前才用脱皮机脱去已经干燥的银皮。湿法加工最大的优点是咖啡豆外观品质优良，原味保持良好：缺点是加工成本较高，需大量的水。一般用于优质咖啡豆的加工。
3、烘焙
咖啡豆烘焙就是将生豆利用特定的设备，经过高温方式将其中的淀粉转化为糖和酸性物质的过程，在这个过程中，纤维素等物质会不同程度的炭化，水分和二氧化碳会挥发掉，而蛋白质会转化成酶，和脂肪的剩余物质结合在一起，在咖啡表面形成油膜层，咖啡豆本身也会通过烘焙而膨胀，内部产生孔隙。经过烘焙后的咖啡豆能产生特殊的香味和不同的风味，才能用于冲泡咖啡。
咖啡豆烘焙是一项繁杂的加工工艺，具相当的专业性，想制作出可口的咖啡豆，需要有完善的设备和较高的咖啡烘焙技术，所以，除非是为了满足个人乐趣，一般不适合在家庭中进行。
