果实和新梢在谢花后开始发病，应在4月底至5月初喷施第一次药剂。防治果实和枝梢黑点病，可选用安泰生（70%丙森锌）500倍液、75%百菌清800倍液、77%氢氧化铜600倍液、70%甲托基布津800倍液或50%多菌灵600倍液等均有较好效果。防治主干和枝条上的病斑，先用利刀刮除病部组织，再用10%纯碱水消毒后再涂1：1：20波尔多液或常用杀菌剂30-50倍液保护伤口，伤口宽度达到主干或枝条周长1/5以上的须用薄膜包扎。
前期使用安泰生500倍液加70%甲托基布津800倍液和后期使用75%百菌清800倍液组合喷药，防治柑橘黑点病的效果比较好
