原因有：幼苗根系弱、水肥不足、病虫害影响等，最主要的原因是由根部问题引起的“黄化”。
根系受病虫害、渍水泡根、施肥用药不当等因素影响，造成根系受损，毛细根减少，直接影响黄金百香果树对中微量元素的吸收，因此容易出现类似缺素症黄化，或者生长发育不良，导致挂果率低；情况严重的，甚至停止生长。
（根系受损，导致镁元素吸收受阻出现的老叶倒"V"字黄化，并伴有炭疽病害）
根很关键：
百香果的根为肉质根，浅根系作物，忌积水，又怕干旱，大面积种植土层要求在0.5米以上，土质疏松，排水好，要为百香果生长创造适宜的环境。
任何作物都是由根生而生，由根亡而亡，健壮发达的根系是作物生长和高产的基础。在土壤问题频出的当今，只有做好作物的养根护根壮根工作，才能取得高产高效。
通常通过百香果根系的颜色，可以简单判断植株的生长情况：
白根有劲：
白根一般都是新根或是老根的尖端部分，这些根泌氧能力强，能使周围的土壤呈氧化状态，形成一个氧化圈，将其周围的可溶性二价铁氧化成三价铁沉淀，使其不聚积在根的表面，保持了根的白色。白根有很强的生理功能，生命力和吸收能力都很强，所以说白根有劲。
黄根保命：
黄根一般出现在老根和根的基部表面。这些根因为老化，外皮层细胞壁增厚，三价铁沉积在根上，成为黄褐色铁膜。这层铁膜有保护作用，可防止有毒物质浸入根的内部，但这种根系吸收能力大大减弱，所以说黄根要保命。
黑根生病：
长期淹水以后，由于土壤内氧含量不足，二价铁较多，同时，有机质进行嫌气分解，产生硫化氢等一系列有毒物质。当硫化氢和二价铁相结合时，便生成硫化亚铁（黑色）沉淀在根表，使根变成黑色。这种根生理机能进一步衰退，所以说黑根生病。
灰根要命：
若土壤缺乏铁元素，硫化氢得不到消除，能抑制根系的呼吸作用和吸收功能，使根中毒死亡。硫化氢中毒症状是拔起根系观察根系呈灰色水渍状，有臭鸡蛋气味，所以说灰根要命。
（常见伪劣无纺布育苗袋，束缚根系生长，另外根系渍水，严重烂根）
养根必养土：
正是由于土质出问题，所以导致很多肥料根系无法吸收，甚至，有利于有害病菌的滋生，容易导致百香果树出现各种各样的问题。所以，“养树先养根，养根必养土”。
调节土壤pH值
长年不合理施肥，导致耕层pH值变化，这是当今土壤问题发生的根源。百香果的最适宜的土壤酸碱度为5.5—6.5，酸性偏重的果园，可以撒石灰或白云石粉调节酸碱度。
增施生物菌肥
增施生物菌肥可以活化土壤，解决土壤板结问题，为作物提供全价养分，并能以菌抑菌，减少土壤中有害菌或有害生物，减少病虫害，增产效果显著。
增施有机质
有机质是沃土的上选，作用是松土、透气，形成团粒结构，保水、保肥，提高微生物活性，促根系发育。优质高产，有机肥必不可少。也可以施用含腐植酸或氨基酸，对于补充有机质、提高地温、提高土壤透气性、提高肥料利用率、养根护根壮根都有积极的意义。
合理排灌
要开好排水沟，高土墩种植，建议采取微灌或滴灌方式，以保护土壤的团粒结构，利于根系生长。露地作物在雨季排水系统同灌水系统一样重要，既防涝灾，又防死根。
注意事项：
合理施肥
施足基肥是百香果优质高产的基础，还要根据土壤肥力和不同时期长势施肥，百香果多次开花多次结果，消耗养分很大，要及时补充养分。不要过量使用氮肥，避免徒长，合理施用有机肥，先把根养好。叶片出现缺素症“黄化”，先检查根系情况，再用中微量元素叶面肥作补充，并及时在防控根系病虫害的基础上，养土养根。
注意真菌病害和除草剂伤害
棚区阴闭，通风采光差，排水不良的果园，容易爆发茎基腐病、炭疽病、疫病等病害导致病害性黄叶，另外选用低毒、低残留农药，慎用草甘膦除草剂，避免除草剂伤害
