洪水毁坏农田的修复责任通常由地方政府承担。具体来说，根据我国《自然灾害救助条例》，当自然灾害发生导致农田受损时，地方政府应当组织相关部门和力量进行抢险救灾和灾后恢复工作，包括修复农田、恢复灌溉设施等。地方政府会根据灾情的严重程度和农田受损的情况，制定相应的修复计划，并动员农民参与修复工作。
此外，国家也会提供相应的救灾资金和政策支持，用于农田的修复和灾后恢复。地方政府可以向上级政府申请救灾资金，用于修复受损的农田和农业设施。
需要注意的是，具体的修复责任和措施可能会因地区、灾情等因素而有所不同。在实际操作中，地方政府会根据具体情况制定相应的政策和措施，确保农田的修复工作得以顺利进行。
