1、亲本选择
单胚与少胚品种的应用。柑橘类果树与其他果树相比，不仅种间容易杂交而且与其近缘积属、金柑属之间也容易杂交，但大多数柑稿类品种的种子都是多胚的，如果以多胚品种为母本，由于珠心胚的干扰，要获得杂交有性苗是比较困难的，同时多胚品种的合子胚往往受压制，不容易得到杂交有性苗，即使得到有性苗，在结果前也很难鉴别。因此在选择母本时，一般选单胚或少胚品种获得有性杂交苗的机率比较大。如日本、美国等，以单胚的克里迈丁红橘为母本与奥兰多橘杂交获得日辉橘柚，与碰柑杂交获得费来蒙特橘，与丹西红橘杂交获得福琼橘，与明尼奥拉橘袖杂交获得佩奇橘等。我国浙江省柑橘研究所以单胚慢橘为母本与文旦杂交也获得慢文柑。
不育性品种的利用。柑橘类品种中如脐橙、温州蜜柑、南丰蜜橘、伏令夏橙、马叙葡萄袖和克里迈丁红橘一奥兰多精袖、明尼奥拉、佩奇、高班袖、麻豆文旦等品种产生少核或无核的主要原因，是生殖器官不育或自交不亲和等因素所致。利用这些品种作为杂交育种的亲本获得有性苗的机率大。如日本、美国等，以特罗维塔甜橙(华脐变种)与宫川早熟温州杂交育成清见橘橙；以清见橘橙为母本与中野碰柑杂交获得阳香、不知火；以清见福橙与费尔柴尔德橘(克里迈丁红橘x奥兰多橘柚杂交育成南风;以清见为母本与明尼奥那杂交育成清峰；以清见为母本与兴津早熟杂交获得津之香；以三保早熟温州为母本与克里迈丁红橘杂交育成南香；以邓肯葡萄柚为母本与丹西红橘杂交育成明尼奥拉；以清家脐橙为母本与克里迈丁红橘杂交育成有明。
2、杂交育种的操作技术
选好杂交组合后，准备好小镊子，杂交用纸袋。杂交用母本树要选择在便于杂交操作，有叶花多的树，父本品种在开花前用小镊子挑开花蕾，收集雄蕊，加温干燥，促使开放，采集花粉。对温州蜜柑、脐橙等没有花粉或少花粉品种，要预先培育盆栽幼树，提前置入温室加温，待开花时采集花粉,然后凉干贮藏备用。杂交时选含苞欲放的花蕾除去雄蕊，将花粉涂在柱头上套好纸袋，防止昆虫异花授粉。同时尽可能摘除已授粉花的周围的花，确保可靠结果，再挂上标签。果实成熟按标签记载仔细采收，取籽贮藏。
