1、土壤原因。大葱根系不是很发达，在种植大葱时，如果土质比较硬，或者是土壤板结厉害，都会导致大葱根系无法吸收土壤养分，或根系在土壤中呼吸不畅，都会导致大葱根系烂根情况的发生。此外土壤偏酸性，也容易导致大葱烂根。
解决方法：合理轮作，在种植大葱时，最好是不要在和大葱或者是百合类作物后种植，因为在一块土地上一直种植同一品类的作物，容易导致土壤中某些元素缺失，从而使大葱容易出现烂根。除了要合理轮作以外，在种植大葱时应使用农家肥，最好不要或少使用化肥，改良土壤环境，并补充大葱生长所需养分，从而减少大葱烂根现象的发生。
2、田间管理不当。大葱是耐旱却不耐涝，如果在大葱生长期间长期处于涝田中，大葱便很容易出现烂根。
防治方法：在大葱生长期间要做好灌水排涝工作，大葱对水分的需求不是很高，所以在大葱生长期间可根据土壤墒情、天气情况以及大葱长势合理安排灌水工作，切忌不可以大水漫灌。在降雨后要及时将田间的积水排出去，对于有轻微烂根的地块，及时中耕松土，使土壤变的更加疏松，有利于大葱根系的生长和恢复，从而恢复大葱的长势。
3、病虫害导致。大葱烂根主要由大葱病虫害造成，根腐病、软腐病、根蛆等病虫害都会引起大葱烂根。
根腐病：根腐病是一种真菌性病害，主要潜伏在大葱种子、土壤中，所以根腐病多发生在重茬种植的地块中。根腐病多发生在高温高湿的环境下，会通过雨水、气流等媒介进入到大葱地下害虫侵蚀的伤口或物理伤口中。根腐病多发生在大葱的幼苗期，发病初期，植株并不会有明显变化，根系会出现腐烂现象，严重时，新长出来的叶子开始发黄枯萎，根皮颜色变深、腐烂，最后整株死亡。
防治方法：合理轮作，与非葱类作物进行轮作。因为根腐病多发生在高温高湿的环境下，所以在高温多降雨的天气下，应减少浇水的次数，并及时排涝。在根腐病发生高发期，可用甲霜灵锰锌灌根，防止病菌发生。在发现大葱新长出来的叶子开始发黄后，可扒开垄土观察，若已经感染根腐病，可用普力克连续灌根2-3次，彻底消灭根腐病病菌。
