养猪场主可以按照以下步骤进行处理：
理解相关法规：了解当地的环保法规和政策，明确养猪场所存在的违规行为和环境污染问题。
接受检查和通知：接受环保局的检查和通知，确认关停决定的合法性和合理性。
寻求法律援助：如认为关停决定存在问题或不合理，可以寻求法律援助，咨询专业律师，了解自己的权益和可行的法律途径。
配合整改：如果确实存在环境污染问题，养猪场主应积极配合环保局的整改要求，采取必要的措施改善环境状况。
提交申诉或上诉：如果认为关停决定不合理或存在错误，可以向相关部门提交申诉或上诉，提供相关证据和理由，争取自己的合法权益。
合规运营或关闭养猪场：根据最终的决定结果，养猪场主需要根据要求进行合规运营或关闭养猪场。如果需要关闭养猪场，应按照相关规定进行清理和处理。
