安全间隔期是指农产品在最后一次使用农药到收获上市之间的最短时间。在此期间，多数农药的有毒物质会因光合作用等因素逐渐降解，农药残留会达到安全标准，不会对人体健康造成危害。不同品种的农药有不同的安全间隔期。
化学农药都有安全间隔期，而生物农药则由于类型较多而情况比较复杂。
一般来说，以生物体为有效成分的生物农药，包括白僵菌、绿僵菌、病毒杀虫剂、苏云金杆菌制剂、线虫杀虫剂、微孢子虫制剂等，以及大部分的植物源农药都没有规定的安全间隔期，也就是说，应用这些生物农药没有限制，不存在任何残留超标问题。
抗生素类农药，不论是杀虫剂还是杀菌剂，如阿维菌素、井冈霉素、链霉素等，多数都有规定的安全间隔期，也就是说这些生物农药有一定的残留超标风险，使用时应该在收获前一定期限内停止使用。由于不同类型的作物对残留的要求不同以及采收方式不同，所以同一种农药在不同作物上的安全间隔期也不相同，例如阿维菌素，在蔬菜上的安全间隔期为7天，而在果树上为20天。
